Этимологический словарь Крылова
Образовано от луна; буквально – "маленькая луна", в диалектах еще известного. Так называют ямку, впадинку, прорубь по их округлой форме, но, в отличие от луны, эти предметы не имеют свойства "блестящий, белый".
лунка