Этимологический словарь Крылова
скважина
Называем ли мы этим словом отверстие под ключ или глубокое отверстие в земле, признак, по которому они названы, остается: и то, и другое стремится пройти сквозь: в первом случае дверь, во втором – землю, и если внимательно к ним приглядеться и прислушаться, то станет очевидно, что слова скважина и сквозь восходят к одной основе.