Этимологический словарь Макса Фасмера
шкипер
шки́пер
стар. щипор, шхипор, шкипер, начиная с Петра I; см. Смирнов 329. Из нидерл. sсhiрреr, ср.-нж.-нем. sсhiрреrе, ср.-в.-н. schifhërre; см. Мёлен 181; Фальк – Торп 999. Едва ли из др.-сканд. skipari, вопреки Горяеву (ЭС 423).